Su Ürünleri Mühendisliği Bölümü’nün amacı öğrencilerin yetiştiricilik, balıkçılık ve doğal canlı su kaynaklarının yönetilmesi konularında bilgi ve becerileri elde etmesini ve var olan becerilerini geliştirmesi için nitelikli ve çağın gereklerine uygun eğitim vermektir. Bu bilgi ve deneyim yetiştiricilik, balık biyolojisi, balıkçılık ekolojisi, balık hastalıkları, su ürünleri işleme ve değerlendirme ve su ürünlerinin diğer ana başlıkları ile ilgili konuları içermektedir. Bu deneyim ve bilgi ile donatılan öğrenciler, sayısal argümanları anlayabilme, okuduğu metni olumlu yada olumsuz olarak eleştirebilme, okuduğu materyalden sonuç çıkarabilme, ve bu bilgileri balıkçılık, doğal kaynak yönetimi ve yetiştiricilik konularına uygulayabilme kabiliyetlerini elde edeceklerdir. Vereceği eğitim-öğretimle başarılı öğrenciler tarafından öncelikle tercih edilen, dünya standardında bilim, teknoloji ve mühendislik bilgileriyle donanmış, kendini sürekli yenileyen, girişimci, çalışmaya yatkın ve çevreye duyarlı su ürünleri mühendisleri yetiştirmek bölümün önceliklerindir.